内部控制是高等学校规范经济活动、防范运营风险、提升治理能力的基础性制度安排。近年来，从行政事业单位内部控制基础规范，到教育部直属高校经济活动内部控制指南，再到科学事业单位内部控制指导意见和基础规范启动新一轮修订，高校内部控制政策框架持续完善，内控建设正从制度覆盖走向有效运行、从财务领域向科研经费等高风险领域深化的新阶段。

1 政策脉络：高校内控监管框架日趋完善

我国高校内部控制建设有着清晰的制度演进路径。财政部印发的《行政事业单位内部控制规范（试行）》（财会〔2012〕21号）首次系统构建了我国行政事业单位内部控制基本框架；《财政部关于全面推进行政事业单位内部控制建设的指导意见》（财会〔2015〕24号）进一步明确建设任务和时间表；《行政事业单位内部控制报告管理制度（试行）》（财会〔2017〕1号）确立了单位内部控制报告编报与审核机制。上述制度均适用于作为事业单位的高等学校。

针对教育行业特点和高校经济活动复杂性，教育部先后印发《教育部关于直属高校落实财务管理领导责任严肃财经纪律的若干意见》（教财〔2015〕4号）和《教育部直属高校经济活动内部控制指南（试行）》（教财厅〔2016〕2号），以后者为核心形成了"实施指南＋应用指南＋评价指南"三位一体的高校内控操作框架。

2023年，中央办公厅、国务院办公厅印发《关于进一步加强财会监督工作的意见》，2024 年12月，财政部、教育部关于印发《关于进一步加强 高等学校内部控制建设的指导意见》的通知。将单位内部控制建设作为财会监督体系的重要组成部分。2025年11月21日，财政部、科技部联合印发《关于进一步加强科学事业单位内部控制建设的指导意见》（财会〔2025〕30号），明确其他科研项目承担单位涉及科研活动内部控制的参照执行，高校科研经费管理直接纳入新一轮政策视野。

2026年10月，财政部以财办会〔2026〕36号就《行政事业单位内部控制规范（修订征求意见稿）》公开征求意见，要求于2026年10月31日前反馈。修订落实新修改的会计法和《关于进一步加强财会监督工作的意见》，适用范围扩展至各级党的机关、人大机关、行政机关、政协机关、监察机关、审判机关、检察机关、各民主党派机关、群团机关和事业单位。行业专项指南、部门指导意见与基础规范同步升级，高校内部控制监管框架更加完整。

2 政策要点解读：教育部直属高校内控指南的核心要求

《教育部直属高校经济活动内部控制指南（试行）》明确，高校内部控制是学校为实现办学目标，通过制定制度、实施措施和执行程序，对经济活动风险进行防范和管控的过程。其目标包括保证学校经济活动合法合规、资产安全和使用有效、财务信息真实完整，有效防范舞弊和预防腐败，提高资源配置和使用效益。

指南确立了全面性、重要性、制衡性、适应性四项原则，并构建了清晰的治理架构：学校党委发挥领导作用，校长是内部控制建设工作的首要责任人，学校领导班子其他成员抓好各自分管领域建设，各部门负责人承担本部门具体责任；成立由校长担任组长的内部控制建设领导小组，明确牵头职能部门，并组建由内部审计部门或相关部门牵头的监督检查工作小组。

在业务层面，指南以15个应用指引覆盖高校经济活动的全部关键领域：控制环境、预决算管理、资产管理、债务管理、收入管理、支出管理、合同管理、采购管理、工程项目管理、科研项目管理、财政专项项目管理、经济活动信息化管理、所属企业管理、教育基金会管理和其他附属单位管理。要求综合运用不相容岗位相互分离、内部授权审批控制、归口管理、预算控制、财产保护控制、会计控制、单据控制、信息内部公开等控制方法，实现"以预算为主线、资金管控为核心"的流程协同。

在监督评价上，指南要求建立健全内部控制的监督检查和自我评价制度，将监督检查、自我评价结果纳入领导干部经济责任审计内容与干部考核体系、与个人考核挂钩，实行追责问责，并逐步建立健全内部控制自我评价报告公开制度。对于所属企业、教育基金会等附属单位，通过会计委派、报表审核、内部审计、委托社会审计等方式加强监管。

3 政策要点解读：科研经费内控与规范修订新要求

《关于进一步加强科学事业单位内部控制建设的指导意见》（财会〔2025〕30号）是近年来直接作用于高校科研活动的标志性政策。该意见为贯彻落实新修改的会计法和财会监督意见而制定，要求加强科研活动内部控制建设，其他科研项目承担单位涉及科研活动内部控制的参照执行。高校作为科研经费规模庞大、科研项目管理链条复杂的科研项目承担单位，科研经费内控由此进入政策强约束阶段。

与之配套，科学技术部2026年3月20日起施行《科学技术活动违规行为调查处理规定》（科学技术部令第24号），对科研项目违规行为调查处理作出规范。高校科研经费管理面临"放管服"与"强内控"并行的新要求：既要落实科研自主权，又要对项目合同、预算调整、报销凭证、采购明细实施全过程控制。

《行政事业单位内部控制规范（修订征求意见稿）》则从基础规范层面提出新要求：落实新修改的会计法，将内部控制与财会监督贯通；适用范围扩展至党的机关、人大机关、行政机关、政协机关、监察机关、审判机关、检察机关、各民主党派机关、群团机关和事业单位，高校作为事业单位将直接适用修订后的规范。

4 行业实践：高校内控建设的重点领域

从政策要求与行业实践看，高校内部控制建设围绕"单位层面＋业务层面"双维度展开。

单位层面，重点是治理架构与运行机制。高校普遍成立内部控制建设领导小组，明确牵头部门，将内控建设纳入学校长期规划；针对基建、后勤、采购、财务等关键岗位建立定期轮岗制度，不具备轮岗条件的以专项审计替代；通过不相容岗位分离、分级授权、集体决策实现分事行权、分岗设权、分级授权。

业务层面，预决算管理强调预算与事业发展规划匹配，严格执行预算调整程序，推进预算绩效评价；收支管理强调收入票据与支出审批全流程规范；采购管理聚焦仪器设备、教学科研耗材、图书资料和后勤物资，落实政府采购归口管理与验收结算控制；合同管理覆盖订立、履行、变更与归档全过程，强化合同会签和授权审批；工程项目管理严控基本建设立项、招投标、变更签证与竣工结算；科研经费管理则逐步建立项目合同、预算调整、报销审核、结题决算的闭环控制，并延伸到所属企业、教育基金会等附属单位。

信息化是高校内控落地的重要支撑。指南要求将经济活动及其内部控制流程嵌入信息系统，实现各重要信息系统互联互通、信息共享和业务协同，同时强化信息系统安全管理与用户权限控制，以技术手段固化制度流程，减少人为操纵空间。

5 案例透视：监督整改暴露的高校内控短板

地方纪检监察机关和巡视巡察公开的整改通报，持续揭示高校内部控制的实际短板。

在科研经费领域，天津市纪委监委驻天津师范大学纪检监察组在日常监督中发现学校存在科研经费管理条款不明确、预算调整不规范、部门把关不严格、横向课题经费比例不合理、未建立科研经费异常预警机制等10余项问题，通过批量核验近三年结题项目、大额经费项目的合同、报销凭证、采购明细等台账资料，督促学校制定科研经费管理制度6项、建立科研经费使用动态监控机制，并建立科研、财务、审计等部门参加的一体化综合监督联席会议制度。

在后勤与基建领域，天津市纪委监委驻天津工业大学纪检监察组深化后勤保障领域廉洁风险防控，围绕工程建设、维修改造、物资采购、食堂管理、物业服务、能源保障、场地出租出借等重点环节开展"拉网式"风险排查，共梳理排查廉洁风险点32个，制定防控措施79条，逐一明确责任人、任务目标和整改时限。驻天津理工大学纪检监察组则联动科技处、审计处，对横向科研项目、成果转化、合同管理开展专题调研监督，推动完善合同管理办法，强化合同签订前审查核验、履行中动态监管、完结后整理归档的全链条闭环管理。

在巡视巡察层面，浙江农林大学2026年7月公布省委巡视整改情况，提出统筹推进校内巡察和审计工作，完成11个财务审计项目，发布《审计发现问题风险提示单》；保山中医药高等专科学校2026年5月公布巡察整改进展，研究制定公务用车管理、差旅费管理、学校采购管理等相关制度10余项，同步修改完善制度10余项。2026年6月，光明网报道国内多所高校依据《科学技术活动违规行为调查处理规定》和财会〔2025〕30号等文件精神开展科研项目自查自纠，海南大学等高校对科研项目开展倒查与核查。

这些案例的共同特征，是高校在科研经费、采购、合同、后勤保障等关键环节的控制执行存在薄弱环节，预算刚性约束、不相容岗位分离、授权审批和闭环管理仍有缺口，需要通过制度完善、动态监控和监督联动持续补齐。

6 高校内控提升路径

一是健全治理责任体系。落实党委领导、校长负总责的要求，成立内部控制建设领导小组，明确牵头职能部门和部门岗位职责，将内控建设纳入学校长期规划和干部考核，形成决策、执行、监督相互分离、相互制约的治理机制。

二是完善风险评估机制。对照指南和最新政策要求，围绕预决算、收支、采购、资产、基建、合同、科研经费等重点领域系统梳理业务流程，识别风险点、形成风险清单，对重点领域关键岗位实行定期轮岗，不具备轮岗条件的以专项审计等控制措施替代。

三是强化重点业务控制。以"预算为主线、资金管控为核心"，严格落实预算刚性约束和调整审批程序，规范采购归口管理与验收结算，完善合同全链条管理，推进科研经费全过程闭环控制，同步加强所属企业和教育基金会等附属单位监管。

四是加快信息化建设。将岗位职责、制度流程、控制措施嵌入信息系统并固化，推动财务、采购、科研、合同等系统互联互通、数据共享，强化系统权限管理和操作留痕，实现业务活动可控制、可追溯。

五是健全评价整改闭环。由内部审计或监督部门定期开展内部控制评价，及时编报内部控制报告，将评价结果与绩效管理、监督问责、经济责任审计挂钩，对评价和监督检查发现的问题建立整改台账、逐项销号，推动高校内部控制从建设走向有效运行、持续改进。

高校内部控制建设既是规范经济活动的制度工程，也是完善现代大学治理、保障教育事业高质量发展的基础工程。随着财会〔2025〕30号等新政策落地和基础规范修订推进，高校内部控制将更加突出风险导向、过程管控与实效评价，为高校落实立德树人根本任务、服务高水平科技自立自强提供坚实支撑。